SORU
9 Kasım 2009, PAZARTESİ


Her satır için bir R dataframe içinde

Bir dataframe var, ve bu dataframe her satır için bazı karmaşık aramalar yapmak ve bir dosya için bazı veri eklemek var.

Bu dataFrame 96 plaka gibi bir şey yapmak istiyorum yani biyolojik araştırmada kullanılan: seçili wells için bilimsel sonuçlar içerir

for (well in dataFrame) {
  wellName <- well$name    # string like "H1"
  plateName <- well$plate  # string like "plate67"
  wellID <- getWellID(wellName, plateName)
  cat(paste(wellID, well$value1, well$value2, sep=","), file=outputFile)
}

Usul benim dünyamda, bir şey yap:

for (row in dataFrame) {
    #look up stuff using data from the row
    #write stuff to the file
}

""Ne için bu? R yolu nedir

CEVAP
9 Kasım 2009, PAZARTESİ


Bu, apply() fonksiyon kullanmayı deneyebilirsiniz

> d
  name plate value1 value2
1    A    P1      1    100
2    B    P2      2    200
3    C    P3      3    300

> f <- function(x, output) {
 wellName <- x[1]
 plateName <- x[2]
 wellID <- 1
 print(paste(wellID, x[3], x[4], sep=","))
 cat(paste(wellID, x[3], x[4], sep=","), file= output, append = T, fill = T)
}

> apply(d, 1, f, output = 'outputfile')

Bunu Paylaş:
  • Google+
  • E-Posta
Etiketler:
R

YORUMLAR

SPONSOR VİDEO

Rastgele Yazarlar

  • colacas

    colacas

    29 EKİM 2006
  • Dave Wallace

    Dave Wallace

    27 Kasım 2007
  • sghaff1

    sghaff1

    23 Mart 2009